Με την επιτυχή ολοκλήρωση του παρόντος ερευνητικού προγράμματος θα δοθεί η δυνατότητα στην ελληνική ιχθυοκαλλιέργεια και τους ερευνητικούς φορείς που την υποστηρίζουν να εισέλθουν σε μια νέα περίοδο ανάπτυξης στηριζόμενη στην οικονομία της γνώσης και στις δυνατότητες που δημιουργούνται από την χρήση της γενωμικής επιλογής.
Το πρώτο απτό αποτέλεσμα του έργου θα είναι:

• η επιλογή δεικτών SNP για το σχεδιασμό δυο μικροσυστοιχιών μονονουκλεοτιδικών δεικτών (SNPchip) ειδικών για τα ελληνικά αποθέματα λαβρακιού και τσιπούρας.
• Μια μικρoσυστοιχία υψηλής πυκνότητας in silico διαθέσιμη για ανάπτυξη και εφαρμογή από την ελληνική θαλάσσια ιχθυοκαλλιέργεια και τους ερευνητικούς φορείς και μια μικρoσυστοιχία χαμηλού κόστους (3.000-8.000 SNP για κάθε είδος) επιλεγμένης χρηστικότητας για άμεση εφαρμογή σε πληθυσμιακές και ελέγχου γενεαλογίας μελέτες ελληνικών πληθυσμών αλλά και άμεση εφαρμογή της γενωμικής επιλογής σε προγράμματα γενετικής βελτίωσης των ελληνικών ιχθυοκαλλιεργειών.

Τα συγκεκριμένα εργαλεία είναι απαραίτητα για την διασύνδεση της ποικιλότητας του γονιδιώματος με την καταγεγραμμένη ποικιλότητας της έκφρασης ποσοτικών ιδιοτήτων που σχετίζονται με χαρακτηριστικά εμπορικού ενδιαφέροντος.

• Οι νέοι αυτοί πόροι που θα αναπτυχθούν θα είναι διαθέσιμοι για οποιαδήποτε άλλη εταιρία παραγωγής τσιπούρας και λαυρακιού ενδιαφέρεται για την χρήση του σε πληθυσμούς που η ίδια εκτρέφει.
• Η χαμηλού κόστους μικροσυστοιχία (π.χ. 3.000-8.000 SNP) θα είναι δυνατόν να χρησιμοποιηθεί τόσο για την ακριβή εκτίμηση της γενεαλογίας αλλά πολύ περισσότερο για την ακριβέστερη εκτίμηση κληροδοτικών τιμών σε χαρακτηριστικά ενδιαφέροντος που είτε δεν είναι δυνατόν να μετρηθούν σε ατομικό επίπεδο είτε είναι πολύ κοστοβόρος η μέθοδος μέτρησής τους.

Στα πλαίσια του προγράμματος θα πραγματοποιηθεί σάρωση του γονιδιώματος των δύο ειδών με σκοπό την ανίχνευση QTL. Η διαδικασία αυτή θα διασφαλίσει την αύξηση της διαθέσιμης γενετικής πληροφορίας για τα δύο είδη. Κατά την υλοποίηση του έργου θα ελεγχθεί η πιθανή διασύνδεση χαρακτηριστικών εμπορικού ενδιαφέροντος με γονιδιακούς τόπους που θα έχουν αναλυτικά καταγραφεί. Με αυτή την διαθέσιμη διασύνδεση οι συνεργαζόμενοι φορείς θα είναι σε θέση να αξιολογήσουν τις μεθόδους επιλογής στην συνέχεια, εάν αυτές θα αφορούν επιλογή ως προς επιθυμητά QTL (MAS) ή γενωμική επιλογή στις περιπτώσεις πολυγονιδιακών χαρακτηριστικών.

Προϊόντα του έργου θα είναι μια καινοτόμος μέθοδος επιλογής για την τσιπούρα και το λαβράκι στηριζόμενη είτε σε γενετικούς δείκτες είτε στην γενωμική επιλογή. Η συγκεκριμένη μεθοδολογία δεν έχει χρησιμοποιηθεί σε κανέναν έως σήμερα πληθυσμό των συγκεκριμένων ειδών που παράγεται στην Μεσόγειο. Η νέα μέθοδος αναμένεται να σχεδιαστεί στα πλαίσια του παρόντος έργου, εφαρμόζοντας παράλληλα τεχνικές phasing και imputation για την μείωση του κόστους εφαρμογής της.

Με την ολοκλήρωση του έργου η ελληνική ιχθυοκαλλιέργεια συμπεριλαμβανομένου του ερευνητικού προσωπικού που την υποστηρίζει θα έχει στα χέρια της ένα νέο εργαλείο (SNPchip), πλήρης ανάλυση του γονιδιώματος των δύο κυριότερων προϊόντων της και μια νέα μέθοδο γενετικής αξιολόγησης. Έχοντας διασφαλίσει βασικές υποδομές και πληροφορίες θα είναι σε θέση να αποτιμήσει το κόστος εφαρμογής και το προσδοκώμενο όφελος για την βελτίωση σειράς εμπορικών χαρακτηριστικών των εκτρεφόμενων ειδών. Με τον τρόπο αυτό όλες οι εταιρίες του κλάδου θα μπορούν να σχεδιάσουν την πορεία τους σχετικά με την βελτίωση του γενετικού υλικού που διαθέτουν, έτσι ώστε να ανταπεξέλθουν στον έντονο ανταγωνισμό της αγοράς.

Η υλοποίηση πολυετών ΠΓΒ ιχθύων με καταγεγραμμένη γενεαλογία, από ελληνικές εταιρίες καθώς και η ύπαρξη ικανών ερευνητικών ομάδων σε ελληνικά ερευνητικά ιδρύματα, δίνει την μοναδική δυνατότητα στην χώρα μας να πρωταγωνιστήσει σε Ευρωπαϊκό και παγκόσμιο επίπεδο.